南京市第二医院（南京中医药大学附属南京医院）肿瘤二科是集医疗、教学、科研为一体的临床学科，是江苏省临床重点专科，拥有医、护人员24人，其中，主任医师1名，副主任医师3人，主治医师6人，主管护师5人，医师均为硕士以上学历，其中博士研究生4人，是一支高素质、高学历充满朝气的医疗护理团队。近五年来，共获得省、市级课题立项17项，科研总经费300余万元，以本科室为通讯作者单位发表SCI论文18篇，国内核心期刊论文29篇，单篇SCI影响因子最高达19.2（Nano Today），参与的文章发表在Nature Biomedical Engineering、Biotechnology advances、ACS Appl. Mater. Interfaces等国际顶级期刊上。获南京市科技进步奖三等奖1项、南京市卫计委新技术引进奖一等奖1项、国家发明专利1项，以副主编或编委身份参与编写专著2部。科室自2013年起每年举办国家级或省级继续教育“恶性肿瘤治疗新进展”学习班，每期接受国内学员200余名，在省内外取得较好的反响。2016年05月护理团队荣获扬子晚报第二届“风尚护士”百姓满意奖。2018年在我院成为南京中医药大学附属南京医院的基础上，肿瘤二科亦成为中医药临床肿瘤研究的带教基地。
肿瘤二科以“抗癌扶正、治病养心”为治疗理念，以“传统与创新并重，科研与临床协同，全面有序协调发展”为方针，以重点专科为平台，立足本地，辐射全国，面向世界，建设高层次、国内一流、国际知名的肿瘤研究中心。
致力于早期肿瘤的辅助治疗、中晚期肿瘤综合治疗及研究，结合国内外较新临床进展和基础研究，制定规范化治疗方案，并积极改善患者的生存质量。对于非小细胞肺癌、胃癌、结直肠癌、食管癌、肝癌、乳腺癌、恶性淋巴瘤等多种实体瘤的综合治疗达到国内外先进水平。具体诊疗项目包括：
1、基因组学指导下的多种恶性肿瘤个体化治疗，包括化疗、分子靶向药物治疗、抗血管生成治疗、免疫治疗、腹腔热灌注治疗、高强度超声聚焦刀治疗、姑息支持治疗。
2、常规实体瘤放疗技术：放疗科开展常见肿瘤三维适形放疗、调强适形放疗（IMRT）、图像引导精确放疗（IGRT）、OPS-红外导航辅助实时定位精准放疗、同步放化疗（头颈部肿瘤、胸部肿瘤、盆腔肿瘤），再程放疗、单次大剂量姑息放疗等；物理组开展二维三维剂量验证、放射源绝对剂量验证等。
3、妇科肿瘤放疗技术：高剂量率近距离后装（腔内）放疗技术治疗宫颈癌、宫体癌、阴道癌等多种妇科恶性肿瘤。
4、肿瘤微创技术应用：TACE、微波消融、射频消融、无水酒精注射等治疗肝脏、肺部多种转移或原发肿瘤；金属支架治疗食管、胆道、呼吸道梗阻；PTCD术缓解梗阻性黄疸等。
5、肿瘤患者的肝脏保护治疗：肝功能异常患者的化疗、化疗相关性肝损伤的治疗、化疗或分子靶向药激活病毒性肝炎以及免疫治疗相关的肝功能异常的治疗。
6、恶性肿瘤晚期合并胸腹腔积液的综合治疗，以及肠梗阻的非手术治疗如肠梗阻导管置入术。
7、癌痛的规范化治疗。